Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNNA3Q9UI47 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNNA3Q9UI47 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms