Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

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Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HDAC6Q9UBN7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HDAC6Q9UBN7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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