Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRPC4Q9UBN4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TRPC4Q9UBN4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms