Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0R6

GSKIP, GSK3B-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSKIPQ9P0R6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GSKIPQ9P0R6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms