Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BATF3Q9NR55 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BATF3Q9NR55 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms