Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LHX9Q9NQ69 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms