Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NRIP3Q9NQ35 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
NRIP3Q9NQ35 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms