Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HMG20AQ9NP66 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms