Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLDIP3Q9BY77 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLDIP3Q9BY77 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLDIP3Q9BY77 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLDIP3Q9BY77 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 288 ms