Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC106Q9BWC9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms