Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SGIP1Q9BQI5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SGIP1Q9BQI5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms