Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms