Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PRRC1Q96M27 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRRC1Q96M27 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms