Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKNOX2Q96KN3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms