Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EAF1Q96JC9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms