Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATRIPQ8WXE1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms