Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NEDD1Q8NHV4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD1Q8NHV4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms