Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU3

SGMS2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS2Q8NHU3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SGMS2Q8NHU3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms