Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
P3H3Q8IVL6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
P3H3Q8IVL6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms