Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LINC00173Q6ZV60 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms