Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC25A47Q6Q0C1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC25A47Q6Q0C1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms