Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC137Q6PK04 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms