Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCTP1Q6DN14 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCTP1Q6DN14 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms