Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SHEQ5VZ18 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms