Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
WDR44Q5JSH3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WDR44Q5JSH3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms