Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CDNFQ49AH0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms