Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC18A3Q16572 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms