Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SNAPC1Q16533 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNAPC1Q16533 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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