Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHRNA6Q15825 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHRNA6Q15825 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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