Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PTPAQ15257 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms