Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NECTIN1Q15223 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NECTIN1Q15223 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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