Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CNGB1Q14028 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CNGB1Q14028 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
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