Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCOA4Q13772 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCOA4Q13772 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms