Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CAMK2DQ13557 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms