Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDC16Q13042 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDC16Q13042 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
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