Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EMX2Q04743 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms