Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ERVK-16P61578 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms