Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NESP48681 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NESP48681 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NESP48681 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NESP48681 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NESP48681 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NESP48681 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NESP48681 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NESP48681 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NESP48681 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NESP48681 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NESP48681 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NESP48681 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NESP48681 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NESP48681 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NESP48681 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NESP48681 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NESP48681 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NESP48681 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NESP48681 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
NESP48681 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NESP48681 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NESP48681 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NESP48681 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NESP48681 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NESP48681 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NESP48681 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NESP48681 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NESP48681 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NESP48681 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
NESP48681 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NESP48681 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
NESP48681 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NESP48681 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NESP48681 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NESP48681 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NESP48681 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NESP48681 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NESP48681 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NESP48681 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NESP48681 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NESP48681 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NESP48681 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NESP48681 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NESP48681 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NESP48681 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NESP48681 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NESP48681 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NESP48681 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NESP48681 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
NESP48681 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NESP48681 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
NESP48681 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NESP48681 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NESP48681 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NESP48681 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NESP48681 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NESP48681 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
NESP48681 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NESP48681 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NESP48681 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NESP48681 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NESP48681 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NESP48681 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NESP48681 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NESP48681 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NESP48681 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NESP48681 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NESP48681 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NESP48681 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NESP48681 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NESP48681 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NESP48681 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NESP48681 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NESP48681 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NESP48681 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NESP48681 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NESP48681 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NESP48681 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NESP48681 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NESP48681 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NESP48681 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NESP48681 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NESP48681 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NESP48681 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NESP48681 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
NESP48681 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NESP48681 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
NESP48681 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NESP48681 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NESP48681 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NESP48681 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NESP48681 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NESP48681 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NESP48681 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
NESP48681 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NESP48681 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NESP48681 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NESP48681 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NESP48681 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms