Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCAMP43121 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCAMP43121 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCAMP43121 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCAMP43121 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCAMP43121 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCAMP43121 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCAMP43121 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCAMP43121 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCAMP43121 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCAMP43121 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MCAMP43121 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
MCAMP43121 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCAMP43121 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCAMP43121 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCAMP43121 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCAMP43121 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCAMP43121 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCAMP43121 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MCAMP43121 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCAMP43121 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCAMP43121 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCAMP43121 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCAMP43121 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCAMP43121 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCAMP43121 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCAMP43121 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MCAMP43121 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCAMP43121 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MCAMP43121 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCAMP43121 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCAMP43121 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCAMP43121 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCAMP43121 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCAMP43121 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCAMP43121 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCAMP43121 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCAMP43121 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCAMP43121 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCAMP43121 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MCAMP43121 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCAMP43121 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCAMP43121 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCAMP43121 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCAMP43121 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCAMP43121 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCAMP43121 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCAMP43121 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCAMP43121 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCAMP43121 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MCAMP43121 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCAMP43121 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCAMP43121 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCAMP43121 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCAMP43121 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCAMP43121 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCAMP43121 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCAMP43121 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCAMP43121 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCAMP43121 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCAMP43121 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCAMP43121 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
MCAMP43121 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCAMP43121 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCAMP43121 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCAMP43121 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCAMP43121 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCAMP43121 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCAMP43121 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCAMP43121 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MCAMP43121 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCAMP43121 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCAMP43121 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCAMP43121 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCAMP43121 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCAMP43121 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCAMP43121 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCAMP43121 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCAMP43121 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCAMP43121 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCAMP43121 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCAMP43121 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCAMP43121 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCAMP43121 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCAMP43121 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCAMP43121 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCAMP43121 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCAMP43121 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCAMP43121 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCAMP43121 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MCAMP43121 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCAMP43121 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCAMP43121 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCAMP43121 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCAMP43121 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCAMP43121 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCAMP43121 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MCAMP43121 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCAMP43121 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MCAMP43121 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms