Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATP5C1P36542 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATP5C1P36542 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms