Protein–RNA interactions for Protein: P34981

TRHR, Thyrotropin-releasing hormone receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHRP34981 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRHRP34981 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRHRP34981 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRHRP34981 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TRHRP34981 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRHRP34981 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRHRP34981 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms