Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CHATP28329 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHATP28329 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHATP28329 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHATP28329 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHATP28329 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHATP28329 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHATP28329 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHATP28329 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHATP28329 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHATP28329 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHATP28329 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHATP28329 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHATP28329 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHATP28329 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHATP28329 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHATP28329 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHATP28329 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHATP28329 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHATP28329 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHATP28329 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHATP28329 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHATP28329 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHATP28329 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHATP28329 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHATP28329 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHATP28329 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHATP28329 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHATP28329 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHATP28329 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHATP28329 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHATP28329 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHATP28329 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHATP28329 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHATP28329 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHATP28329 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHATP28329 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHATP28329 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHATP28329 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHATP28329 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHATP28329 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHATP28329 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHATP28329 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHATP28329 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHATP28329 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHATP28329 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHATP28329 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHATP28329 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHATP28329 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHATP28329 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHATP28329 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHATP28329 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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