Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
IL3RAP26951 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms