Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA1P21709 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms