Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRIM21P19474 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms