Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNNT1P13805 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNNT1P13805 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNNT1P13805 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TNNT1P13805 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNNT1P13805 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNNT1P13805 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNNT1P13805 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNNT1P13805 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNNT1P13805 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNNT1P13805 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNNT1P13805 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNNT1P13805 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TNNT1P13805 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TNNT1P13805 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms