Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PPFIA3O75145 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms