Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG13O75143 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG13O75143 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG13O75143 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG13O75143 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG13O75143 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG13O75143 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG13O75143 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG13O75143 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG13O75143 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG13O75143 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG13O75143 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG13O75143 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG13O75143 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG13O75143 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG13O75143 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG13O75143 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG13O75143 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG13O75143 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG13O75143 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG13O75143 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG13O75143 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG13O75143 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG13O75143 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG13O75143 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG13O75143 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG13O75143 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG13O75143 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATG13O75143 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATG13O75143 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATG13O75143 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms