Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
HOXA2O43364 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXA2O43364 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms