Protein–RNA interactions for Protein: H7C1C5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1C5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1C5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1C5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1C5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1C5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1C5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1C5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1C5 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1C5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1C5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1C5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1C5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1C5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1C5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1C5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1C5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1C5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1C5 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1C5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1C5 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1C5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
H7C1C5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H7C1C5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H7C1C5 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H7C1C5 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H7C1C5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H7C1C5 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H7C1C5 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
H7C1C5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H7C1C5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
H7C1C5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1C5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1C5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1C5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1C5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1C5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1C5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1C5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1C5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1C5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1C5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1C5 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1C5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1C5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1C5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1C5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1C5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1C5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1C5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1C5 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1C5 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1C5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1C5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1C5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1C5 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1C5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
H7C1C5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
H7C1C5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H7C1C5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
H7C1C5 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H7C1C5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
H7C1C5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms